THiCweed output on ENCODE data

These pages contain clustering output of THiCweed and comparisons to database motifs (HOCOMOCO and JASPAR) for ChIP-seq data 122 transcription factros and various cell types from the ENCODE database. Click on links next to each factor for more.


ARID3A (JASPAR) (HocoMoco) (5 datasets)
ARNT (JASPAR) (HocoMoco) (5 datasets)
ATF1 (JASPAR) (HocoMoco) (2 datasets)
ATF2 (JASPAR) (HocoMoco) (2 datasets)
ATF3 (JASPAR) (HocoMoco) (17 datasets)
BACH1 (JASPAR) (HocoMoco) (4 datasets)
BATF (JASPAR) (HocoMoco) (1 datasets)
BCL11A (JASPAR) (HocoMoco) (2 datasets)
BHLHE40 (JASPAR) (HocoMoco) (9 datasets)
BRCA1 (JASPAR) (HocoMoco) (8 datasets)
CEBPB (JASPAR) (HocoMoco) (18 datasets)
CEBPD (JASPAR) (HocoMoco) (1 datasets)
CEBPZ (JASPAR) (HocoMoco) (11 datasets)
CREB1 (JASPAR) (HocoMoco) (1 datasets)
CREM (JASPAR) (HocoMoco) (10 datasets)
CTCF (JASPAR) (HocoMoco) (259 datasets)
CTCFL (JASPAR) (HocoMoco) (1 datasets)
CUX1 (JASPAR) (HocoMoco) (2 datasets)
E2F1 (JASPAR) (HocoMoco) (2 datasets)
E2F4 (JASPAR) (HocoMoco) (8 datasets)
E2F6 (JASPAR) (HocoMoco) (5 datasets)
EBF1 (JASPAR) (HocoMoco) (3 datasets)
EGR1 (JASPAR) (HocoMoco) (3 datasets)
ELF1 (JASPAR) (HocoMoco) (4 datasets)
ELK1 (JASPAR) (HocoMoco) (17 datasets)
ELK4 (JASPAR) (HocoMoco) (4 datasets)
EP300 (JASPAR) (HocoMoco) (19 datasets)
ESR1 (JASPAR) (HocoMoco) (6 datasets)
ESRRA (JASPAR) (HocoMoco) (3 datasets)
ETS1 (JASPAR) (HocoMoco) (3 datasets)
ETV6 (JASPAR) (HocoMoco) (10 datasets)
FOS (JASPAR) (HocoMoco) (16 datasets)
FOSL1 (JASPAR) (HocoMoco) (2 datasets)
FOSL2 (JASPAR) (HocoMoco) (2 datasets)
FOXA1 (JASPAR) (HocoMoco) (5 datasets)
FOXA2 (JASPAR) (HocoMoco) (1 datasets)
FOXK2 (JASPAR) (HocoMoco) (10 datasets)
FOXM1 (JASPAR) (HocoMoco) (1 datasets)
FOXP2 (JASPAR) (HocoMoco) (2 datasets)
GABPA (JASPAR) (HocoMoco) (6 datasets)
GATA1 (JASPAR) (HocoMoco) (7 datasets)
GATA2 (JASPAR) (HocoMoco) (7 datasets)
GATA3 (JASPAR) (HocoMoco) (7 datasets)
GATA4 (JASPAR) (HocoMoco) (5 datasets)
HMBOX1 (JASPAR) (HocoMoco) (5 datasets)
HNF4A (JASPAR) (HocoMoco) (3 datasets)
HNF4G (JASPAR) (HocoMoco) (1 datasets)
HSF1 (JASPAR) (HocoMoco) (2 datasets)
IKZF1 (JASPAR) (HocoMoco) (7 datasets)
IRF1 (JASPAR) (HocoMoco) (8 datasets)
IRF3 (JASPAR) (HocoMoco) (10 datasets)
IRF4 (JASPAR) (HocoMoco) (1 datasets)
JUN (JASPAR) (HocoMoco) (20 datasets)
JUNB (JASPAR) (HocoMoco) (5 datasets)
JUND (JASPAR) (HocoMoco) (15 datasets)
MAFF (JASPAR) (HocoMoco) (9 datasets)
MAFK (JASPAR) (HocoMoco) (13 datasets)
MAX (JASPAR) (HocoMoco) (19 datasets)
MAZ (JASPAR) (HocoMoco) (9 datasets)
MEF2A (JASPAR) (HocoMoco) (3 datasets)
MEF2C (JASPAR) (HocoMoco) (1 datasets)
MITF (JASPAR) (HocoMoco) (5 datasets)
MXI1 (JASPAR) (HocoMoco) (13 datasets)
MYBL2 (JASPAR) (HocoMoco) (1 datasets)
MYC (JASPAR) (HocoMoco) (43 datasets)
NANOG (JASPAR) (HocoMoco) (1 datasets)
NFATC1 (JASPAR) (HocoMoco) (1 datasets)
NFE2 (JASPAR) (HocoMoco) (9 datasets)
NFIC (JASPAR) (HocoMoco) (2 datasets)
NFYA (JASPAR) (HocoMoco) (6 datasets)
NFYB (JASPAR) (HocoMoco) (6 datasets)
NR2C2 (JASPAR) (HocoMoco) (8 datasets)
NR2F2 (JASPAR) (HocoMoco) (1 datasets)
NR3C1 (JASPAR) (HocoMoco) (7 datasets)
NRF1 (JASPAR) (HocoMoco) (17 datasets)
PAX5 (JASPAR) (HocoMoco) (4 datasets)
PBX3 (JASPAR) (HocoMoco) (1 datasets)
POU2F2 (JASPAR) (HocoMoco) (2 datasets)
POU5F1 (JASPAR) (HocoMoco) (1 datasets)
PRDM1 (JASPAR) (HocoMoco) (2 datasets)
RELA (JASPAR) (HocoMoco) (8 datasets)
REST (JASPAR) (HocoMoco) (11 datasets)
RFX5 (JASPAR) (HocoMoco) (12 datasets)
RUNX1 (JASPAR) (HocoMoco) (5 datasets)
RUNX3 (JASPAR) (HocoMoco) (1 datasets)
RXRA (JASPAR) (HocoMoco) (3 datasets)
SIX5 (JASPAR) (HocoMoco) (4 datasets)
SMARCC1 (JASPAR) (HocoMoco) (2 datasets)
SMARCC2 (JASPAR) (HocoMoco) (2 datasets)
SP1 (JASPAR) (HocoMoco) (4 datasets)
SP2 (JASPAR) (HocoMoco) (3 datasets)
SP4 (JASPAR) (HocoMoco) (1 datasets)
SPI1 (JASPAR) (HocoMoco) (3 datasets)
SREBF1 (JASPAR) (HocoMoco) (4 datasets)
SREBF2 (JASPAR) (HocoMoco) (12 datasets)
SRF (JASPAR) (HocoMoco) (4 datasets)
STAT1 (JASPAR) (HocoMoco) (12 datasets)
STAT2 (JASPAR) (HocoMoco) (4 datasets)
STAT3 (JASPAR) (HocoMoco) (12 datasets)
STAT5A (JASPAR) (HocoMoco) (2 datasets)
TAL1 (JASPAR) (HocoMoco) (3 datasets)
TBP (JASPAR) (HocoMoco) (10 datasets)
TCF12 (JASPAR) (HocoMoco) (4 datasets)
TCF3 (JASPAR) (HocoMoco) (1 datasets)
TCF7 (JASPAR) (HocoMoco) (10 datasets)
TCF7L2 (JASPAR) (HocoMoco) (14 datasets)
TEAD4 (JASPAR) (HocoMoco) (3 datasets)
TFAP4 (JASPAR) (HocoMoco) (5 datasets)
TFDP1 (JASPAR) (HocoMoco) (5 datasets)
THAP1 (JASPAR) (HocoMoco) (1 datasets)
USF1 (JASPAR) (HocoMoco) (8 datasets)
USF2 (JASPAR) (HocoMoco) (10 datasets)
YY1 (JASPAR) (HocoMoco) (29 datasets)
ZBED1 (JASPAR) (HocoMoco) (10 datasets)
ZBTB33 (JASPAR) (HocoMoco) (5 datasets)
ZBTB7A (JASPAR) (HocoMoco) (2 datasets)
ZEB1 (JASPAR) (HocoMoco) (1 datasets)
ZKSCAN1 (JASPAR) (HocoMoco) (12 datasets)
ZNF143 (JASPAR) (HocoMoco) (8 datasets)
ZNF263 (JASPAR) (HocoMoco) (4 datasets)
ZNF274 (JASPAR) (HocoMoco) (15 datasets)
ZNF384 (JASPAR) (HocoMoco) (2 datasets)

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